Almanya ve Türkiye arasındaki bağlardan birini de uzun bir geçmişe sahip yoğun askeri ilişkiler oluşturur. Özellikle 1835-1839 yılları arasında Osmanlı Ordusu'nda askeri danışman olarak görev yapan ve daha sonraları mareşalliğe kadar yükselen Helmuth von Moltke deneyimlerini aktardığı raporlarındaki canlılığıyla hatıralarda yer etmiştir. Daha sonra 1883-1896 yılları arasında, ordunun reorganizasyonu ve askeri eğitim reformu konularında Osmanlı İmparatorluğu Erkân-ı Harp Başkanlığına danışmanlık görevini Korgeneral Colmar von der Goltz başkanlığındaki bir askeri delegasyon üstlenmiştir.

I. Dünya savaşı sırasında iki ülke arasındaki müttefiklik Türkiye'de halen anılmakta. Alman Generali Liman von Sanders Osmanlı orduları komutanıydı. Türkiye'nin kurtuluş savaşının akabinde de, 3 Mart 1924’te, yeni kurulan Türkiye Cumhuriyeti ile Weimar Cumhuriyeti arasında, yoğun bir işbirliğinin temelini oluşturacak bir dostluk antlaşması imzalandı.

Uzun bir ortak geçmişe sahip olan ve ortak değerleri savunan iki ülke 50'li yıllardan itibaren NATO çerçevesinde yeniden yakın müttefik oldular. Bugün Türk ve Alman Silahlı Kuvvetleri arasında kişisel ve kurumsal pek çok ilişki ve yoğun bir üst düzey ziyaret trafiği mevcuttur. İki ülkenin askerleri barışı destekleyen görevlerde omuz omuza hizmet vermektedir. Bunun başlıca örneğini iki ülkenin Afganistan'ın istikrara kavuşturulması için gösterdikleri çabalar sırasında gördük. Bu bağlamda Alman birlikleri Şubat 2003'te ISAF komutanlığını, bu görevi altı ay başarıyla yürüten Türkiye'den devraldı.

Bunların yanısıra pek çok ortak NATO tatbikatı ile karşılıklı eğitim projeleri çerçevesinde de ilişkiler mevcuttur. Burada iki ülke subaylarının karşılıklı olarak, İstanbul ve Hamburg’daki harp akademilerindeki eğitimleri ile kara, hava ve deniz kuvvetleri askerlerinin değişimi özellikle belirtilmelidir. Yine, NATO’nun yeni görev tanımı çerçevesinde kurulan NRDC-T (NATO Rapid Deployable Corps-Turkey) ise özellikle anılmaya değerdir. Bu birliğin içinde bir kontenjan Alman askeri İstanbul’da bir Türk generalinin emrinde görev yapmaktadır.